Cerkvė yra centriška, graikiško kryžiaus plano, vyrauja rusų bizantinė architektūra. Popo namas – stačiakampio plano, vieno aukšto su pastoge, namą puošia profiliuoti tinko karnizai. I pasaulio karo metu Kybartų Šv. Aleksandro Neviškio cerkvė buvo paversta sandėliu. 1919 m. Vidaus reikalų ministerija cerkvę, mokyklos pastatą ir 2 parapijos namus perdavė Seinų vyskupijai. Tuomet buvo įkurta bažnyčia. Kybartuose gyvenantys stačiatikiai daug kartų kreipėsi į valdžią prašydami grąžinti cerkvę, kol pagaliau 1929 m. ministrų kabineto nutarimu apgriuvusi cerkvė buvo grąžinta bendruomenei. 1935 m. Kybartų Šv. Aleksandro Neviškio cerkvė buvo atnaujinta. Šiuo metu cerkvė priklauso Kybartų stačiatikių Šv. Aleksandro Nevskio parapijai.
