Tik įžengus į bažnyčią, prieš akis iškyla įspūdingas, marmuru tviskantis barokinis altorius. XVII amžių menantis 16 m aukščio ir 8,2 m pločio medinis altorius yra aukščiausias visoje Lietuvoje.
Jį puošia 22 medinės skulptūros, iš kurių 15 išlikusios nuo bažnyčios pastatymo. Kadangi marmuras buvo brangi medžiaga, talentingi meistrai altoriaus medį dekoravo jį imituojančiomis rusvos, žydros ir rudos spalvų aliejinių dažų gyslelėmis, todėl altorius atrodo prabangiai ir yra vienintelis taip dekoruotas visoje Lietuvoje.
